Будучи падаваном Ша Кун присутствовала в Храме джедаев на Корусанте во время Гиперпространственной войны Старка в 44 ДБЯ. Ее дядя Пло Кун, находившийся в это время на планете Тройкен, смог установить с ней телепатический контакт, несмотря на огромное расстояние. Ша Кун вместе с Пло Куном помогли установить связь через себя между двумя группами джедаев - Советом в Храме и командой на Тройкене. В результате Совет вовремя направил свои ударные силы для оказания помощи, что помогло в конечном итоге благополучно для Республики урегулировать конфликт. Ша Кун стала джедаем и была им на протяжении более 20 лет. Она участвовала в Войнах клонов. Ша Кун входила в состав ударной группы, которая отправилась на планету Внешнего Кольца Бал'демник, где Конфедерация открыла запасы кортозиса. Она намеривалась добывать ее и использовать против джедаев. Ударная группа, включавшая также Халагада Вентора и солдат-клонов, помогла местным жителям кон'ми успешно отбить силы Конфедерации, хотя они же (кон'ми) оборонялись и против группы Ша Кун.В том же году,Ша и Бейлис Арчан были отправлены с командой клонов на Гиджу.В сражение с сепаратистами,ее падаван и все клоны были убиты.После битвы и смерти Бейлиса, Ша вернулся на Корусант, чтобы оправиться от ран, в частности, от одной возле ее правого глаза, и медитировать чтобы излечить свои душевные раны.В дальнейшем она отказалась вернуться к военным действиям.
Вскоре после смерти лидера КНС,дядя Ша (Пло Кун)сказал,что Дуку утверждал,что некто близкий к правящим кругам республики является владыкой ситхов.Ша Кун согласилась и отправилась в архив джедаев.Хранитель-мастер джедай Джакоста Ну предложила помощь но Ша не приняла её предложение.Время шло,Ша как одержимая с головой погрузилась в поиски.И вдруг она почувствовала смерть дяди в силе,резкая боль.Ша проснулась увидела дым и услышала крики,и увидела солдат 501-го легиона задача которых было убить её Ша поняла их намерения и убежала от них.Она не верила своим глазам,Скайуокер убил мастера Ну.Но она смогла сбежать.
